Результаты ТМНММ. Программа выдает график вероятностей для участков последовательности быть трансмембранным, или находиться по какую-либо сторону от мембраны. Розовым выделены наружные петли, красным — трансмембранные участки, синим — внутренние петли. Сверху графика находится изображение последовательности с разметкой участков. Также можно заметить еще один график с противоположными цветами петель — это альтернативный вариант их расположения. Но вероятность этого ниже.
| По профилю гидрофобности | TMHMM | ||
| Всего предсказано (N) | 171 | 171 | |
| Из них | |||
| А. По данным ОРМ находятся внутри мембраны | 136 | 130 | |
| В. Из них - "торчащие" из мембраны остатки на концах спиралей | 35 | 41 | |
| С. Вообще не имеют никакого отношения к трансмембранным спиралям | 0 | 0 | |
| D. Число непредсказанных остатков, которые по данным ОРМ находятся в мембране. | 51 | 77 | |
| Точность предсказания, A/N | 0,795 | 0,760 | |
| Сверхпредсказание, C/N | 0 | 0 | |
| Недопредсказание, D/(L-N), где L-длина последовательности | 0,061 | 0,092 | |
На главную страницу четвертого семестра